Фамилия Двойченковы — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается южнорусское или украинское происхождение. В основе фамилии лежит прозвище Двойник. Чаще всего так называли человека, у которого был брат-близнец. Однако версий несколько: прозвище могло закрепиться за женщиной, родившей двойню (Двойница), или за хозяином «двоенки» — двойной избы из двух срубов, соединённых сенями. В казачьей среде Двойником могли прозвать и владельца пары отличных лошадей.

Ключевая деталь — суффикс -енк(о). Это типичный украинский патронимический суффикс, означающий «маленький» или «потомок»: Двойченко — сын Двойника. Форма Двойченков появилась уже на русской почве, когда фамилию «обрусили», добавив стандартный русский суффикс -ов. Такая русификация особенно характерна для донских казаков, чьи земли исторически граничили с Украиной и где смешивались обе традиции именования.

Таким образом, предок Двойченковых был выходцем с территории современной Украины или юга России, получил прозвище по какой-то из «двойных» примет, а его потомки, перейдя под русскую административную систему, адаптировали фамилию к местному образцу.