Фамилия Двойнякова — яркий пример того, как прозвище, данное по семейному обстоятельству, закрепилось в официальном родовом имени. Её основа — слово «двойня», то есть двое детей, рождённых в одних родах. Предка, который сам был одним из близнецов, или отца, у которого родилась двойня, в народе так и называли — Двойняк. От этого прозвища и пошла фамилия.

Словообразовательная модель здесь классическая для русского севера и центра: прозвище на -як (Двойняк) плюс притяжательный суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Двойняков). Женская форма Двойнякова — это либо дочь, либо жена Двойнякова. Важно, что в фамилии сохранился суффикс -як, который в русских говорах часто придавал прозвищу оттенок характерности: не просто «двойной», а «тот, кто имеет отношение к двойне».

В ономастике встречаются параллельные формы: Двойников, Двояков, Двойнишников. Но Двойняков стоит особняком — он явно указывает на конкретное прозвище, а не на абстрактный признак. Географически фамилия тяготеет к Вологодской, Архангельской и Кировской областям — регионам, где прозвищная модель на -як была особенно распространена. Встречается также в Поволжье, куда её могли занести переселенцы с севера.

Интересная деталь: в некоторых говорах «двойняком» называли не только близнеца, но и предмет, состоящий из двух частей (например, двойной топор или гребень). Однако для фамилии основная версия — именно семейная, связанная с рождением двойни. Споров среди этимологов практически нет: корень прозрачен, а суффикс однозначно указывает на прозвище, а не на отчество от канонического имени.