Фамилия Дюханова — женская форма от мужской Дюханов, и её разбор стоит начать с неочевидного: корня. Внешне фамилия напоминает множество русских фамилий на -анов (от имён Иван, Степан и т.д.), но здесь основа не имя, а тюркское слово. «Дюхан» (или «дукан», «дюкян») в языках Кавказа и Средней Азии означает лавку, торговую палатку, небольшой магазин. Это слово, в свою очередь, пришло из арабского «дуккан» — скамья, прилавок. Поэтому первая и самая прямая версия: Дюханов — сын торговца, владельца лавки, или же человек, получивший прозвище Дюхан (то есть «лавочник», «мелкий купец»).

Однако есть и второй, менее очевидный вариант. В некоторых тюркских говорах «дюхан» могло быть формой имени Дюхан или Духан (как вариант арабского имени Духан — «дым», «туман», или как производное от имени Джухан). В этом случае фамилия образована по русской модели от тюркского имени, и предок носителя был, например, Духаном по имени, а не по занятию. Но прозвищная версия, отсылающая к ремеслу или месту торговли, встречается чаще: в ономастике фамилии, образованные от названий профессий, всегда массово преобладают над антропонимическими (от личных имён), если слово бытовало в языке.

Географически фамилия Дюханова тяготеет к регионам, где исторически были сильны тюркские и кавказские влияния: это юг России, Поволжье, Северный Кавказ, а также Закавказье. Встречается она и у татар, и у народов Дагестана, и у русских, живших в зоне торговых контактов. Суффикс -ов указывает, что фамилия оформлялась уже в русской среде или в среде, где документы вели на русском языке: «Дюханов сын» — «чей?» — «Дюханов». Это типичная модель для XIX века, когда крестьянам и мещанам массово присваивали фамилии по отцу или по прозвищу.

Интересная деталь: в написании фамилии встречается вариант с буквой «и» — Духанова. Это не ошибка, а отражение разного произношения в диалектах: в одних языках звук ближе к «ю», в других — к «у». Оба варианта имеют право на существование, но Дюханова — более редкая и явно указывающая на тюркское происхождение, так как русскому уху сочетание «дю» кажется неродным. Таким образом, носительница фамилии Дюханова почти наверняка имеет предка, который либо держал лавку на базаре, либо был прозван по ней, и жила эта семья на южных рубежах России или в регионе смешения культур.