Фамилия Даханова образована от мужского имени Дахан, которое, скорее всего, является тюркским вариантом арабского имени Давуд (библейский Давид). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, звук «в» часто переходит в «х», а имя Давуд могло звучать как «Дауд» или «Дахут». Отсюда уменьшительно-ласкательная форма Дахан — «маленький Давуд» или «сын Давуда». Суффикс -ов указывает на принадлежность: Даханова — «дочь или жена Дахана».

Встречается фамилия в Поволжье и на Урале, особенно среди татар и башкир, а также в казахской среде, где имя Дахан известно как самостоятельное. В русском контексте фамилия могла закрепиться через крещёных татар или через браки с представителями тюркских народов.

Редкая особенность — ударение в фамилии может падать на второй слог (Даханова), что типично для тюркских заимствований, где имя произносится с ударением на последний слог. В русской традиции ударение смещается на третий слог (Даханова), но в быту носители часто сохраняют исходный вариант.

Искать предков с такой фамилией стоит в метрических книгах мечетей и православных приходов Оренбургской, Уфимской и Казанской губерний — именно там в XVIII–XIX веках фиксировались тюркские антропонимы.