Фамилия Джанаргалиев — редкий пример фамилии, образованной от составного казахского имени. Её основа — мужское имя Джанаргали, что на казахском означает «душа (или возлюбленный) Али». Первая часть «жан» (джан) переводится как «душа», «милый», «дорогой», вторая — «Али» — имя зятя пророка Мухаммеда, одно из центральных в исламе. Таким образом, имя Джанаргали — это ласкательное обращение к Али, подчёркивающее духовную близость. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов) указывает на русскую модель образования фамилий: «сын Джанаргали» или «из рода Джанаргали». Встречается и вариант написания Джанаргалиев, где мягкий знак отражает казахское произношение.

Географически фамилия тяготеет к Западному Казахстану, особенно к Атырауской и Западно-Казахстанской областям, а также к приграничным районам России — Астраханской и Оренбургской областям, где исторически компактно проживают казахи. Встречается она и среди казахской диаспоры в Узбекистане. Социально предки носителей фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, а само имя Джанаргали могло принадлежать человеку, почитаемому в роду за духовность или религиозность — имя с компонентом «Али» нередко давали в честь уважаемого предка или с пожеланием благочестия.

С точки зрения словообразования фамилия нетипична для русского ономастикона: двусоставная тюркская основа с арабским заимствованием (Али) и русским суффиксом. Это отражает процесс адаптации казахских имен в русской среде, особенно в период активных межэтнических контактов в XVIII–XIX веках. Встречаются однокоренные фамилии — Джаналиев, Алиев, Жангалиев, но Джанаргалиев стоит особняком из-за редкого сочетания «жан» и «Али» в полной форме.