Фамилия Джавхаров — яркий пример того, как русская модель фамилии «на -ов» скрещивается с восточным корнем. Перед нами не славянское прозвище, а фамилия, образованная от личного имени. Основа — Джавхар (Джаухар), распространённое у народов Кавказа и Средней Азии имя арабского происхождения. В арабском джаухар (جَوْهَر) означает «драгоценный камень», «жемчужина», «суть», «сущность». Имя давали мальчикам, желая подчеркнуть их ценность для семьи или красоту.

С точки зрения словообразования, фамилия укладывается в общерусскую схему: к основе Джавхар добавили патронимический суффикс -ов, который в русском языке указывал на принадлежность («чей?» — сын Джавхара). Такой способ адаптации иноязычных имён типичен для XIX–XX веков, когда народы Кавказа и Закавказья входили в состав Российской империи, и их фамилии фиксировались в документах по русскому образцу. Если бы фамилия осталась в родной среде, она могла бы звучать как Джавхари (с иранским суффиксом принадлежности) или Джавхарян (с армянским окончанием).

Носители фамилии Джавхаров исторически связаны с регионами, где сильно влияние персидского и арабского языков: это Дагестан, Чечня, Ингушетия, Азербайджан, а также татары и народы Средней Азии. Встречаются варианты написания: Джаухаров, Джохаров, Джухаров. В дореволюционных метрических книгах можно увидеть и форму Джавхаровъ.

Отдельного внимания заслуживает омонимия: у тюркских народов есть слово «джавхар» (в диалектах — «джаухар») со значением «крупный рогатый скот», но для фамилии эта версия маловероятна. Имя Джавхар в исламской традиции настолько популярно (вспомним хотя бы Джавхара ас-Садика, одного из сподвижников), что именно ономастический, «драгоценный» корень является основным. Фамилия не получила широкого распространения за пределами кавказского и среднеазиатского ареала, но в этих регионах встречается нередко, особенно в Дагестане и среди чеченцев.