Фамилия Джексеков — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Её основа, «Джексек», с почти стопроцентной вероятностью восходит к тюркскому мужскому имени Джексек (варианты: Жексек, Джекшек). В казахском и киргизском языках это имя имеет прозрачную внутреннюю форму: «джек» (жек) — «один» или «единый», а «сек» (шек) — «граница», «рубеж». В сумме имя могло означать «единая граница» или «единственный рубеж» — так в кочевой культуре могли назвать мальчика, родившегося в момент укрепления родовых земель, или же это было имя-оберег, символизирующее несокрушимость.

Словообразовательная модель фамилии типична для казахской и киргизской ономастики, адаптированной через русскую паспортную систему: к основе Джексек прибавляется русский патронимический суффикс -ов, образующий фамилию по схеме «чей?» — «сын Джексека». Окончание -ов, а не -ев, указывает на твёрдую основу, что характерно для заимствований, оканчивающихся на согласный. В самой Средней Азии фамилия могла бы писаться как Жексеков или Джексекұлы, но русская канцелярия XIX–XX веков зафиксировала именно вариант с «ов».

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий, где суффикс -ов указывает на принадлежность отцу, здесь он выполняет чисто формальную функцию русификации. Носитель фамилии Джексеков — это, по сути, потомок человека по имени Джексек, а не обладатель прозвища, связанного с ремеслом или внешностью. Социальный контекст: фамилия почти наверняка принадлежит к казахскому или киргизскому роду, и её носители — не крестьяне и не дворяне в русском понимании, а представители кочевых общин, где личное имя играло роль социального маркера.

Встречаемость фамилии крайне низкая за пределами Казахстана и приграничных районов России. В дореволюционных метрических книгах она практически не фиксируется, что объяснимо: массовое закрепление фамилий у кочевых народов произошло только в советское время, в 1920–1930-е годы. Поэтому искать древнюю историю фамилии Джексеков в документах XVI–XVII веков бессмысленно — её корни уходят в тюркскую антропонимику, а не в русскую сословную иерархию.