Фамилия Джексимбаева — редкий случай в русском ономастиконе, но для носителя она прозрачна: это женская форма мужской фамилии Джексимбаев. Корень уходит в тюркское личное имя Джексимбай, которое в свою очередь состоит из двух частей. Первая — «джексим» (вариант «жаксым», «якши»), восходящая к общетюркскому «якшы» — «хороший», «добрый», «славный». Вторая — «бай», традиционный компонент тюркских имен, означающий «господин», «богач», «хозяин». В целом имя Джексимбай можно перевести как «добрый господин» или «славный богач».

Фамилия образована по продуктивной для тюркских языков модели: к имени добавлялся патронимический суффикс -ев/-ов (в русской передаче), указывающий на принадлежность: «сын Джексимбая». В казахском и других тюркских языках эта фамилия звучала бы как Жаксымбаев или Джаксымбаев, но в русском письме через «е» и «к» закрепился вариант Джексимбаев — из-за особенностей передачи звуков через кириллицу.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам Казахстана и к казахской диаспоре в России, особенно в Оренбургской и Астраханской областях. Встречается она редко — это не массовая фамилия, а скорее локальная, что говорит о её относительно позднем закреплении в документах (вероятно, конец XIX — начало XX века, когда у казахов начали массово фиксировать фамилии по отцу).

Сословный аспект здесь не прослеживается: Джексимбаевы не принадлежали к княжеским или дворянским родам. Скорее всего, предки были скотоводами или земледельцами, а имя Джексимбай дали ребенку как пожелание благополучной и обеспеченной жизни — типичный для кочевой культуры оберег-имя.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то в той же среде бытуют Жаксыбаев, Якшибаев, Джаксымбетов — все они образованы от одного корня «якшы», но с разными вторыми компонентами. Джексимбаева выделяется именно редким сочетанием «джексим» вместо более привычного «жаксы», что может быть следствием диалектного произношения или особенностей записи в метрических книгах.