Фамилия Джениусов — редкий случай, когда русская фамилия образована от прямого заимствования, а не от прозвища или крестильного имени. Её основа — латинское слово genius («гений», «дух-покровитель»). В русском языке слово «гений» закрепилось в XVIII—XIX веках, в эпоху увлечения античностью и европейским просвещением. Фамилия могла возникнуть в среде, где латынь была языком образования и науки — в духовных семинариях, академиях или в дворянских семьях с гуманитарными традициями.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединяется к основе, указывая на принадлежность («чей?»). Однако исходная форма — не имя, а абстрактное понятие. Это сближает Джениусова с фамилиями типа Философов, Интеллигентов, Астрономов, которые тоже возникали как искусственные, книжные, а не из бытовых прозвищ. Впрочем, возможен и другой путь: фамилию могли дать в семинарии по фамилии преподавателя или по прозвищу однокашника, которого за способности называли «гением» (в латинской огласовке — джениус).

Написание через «дж» — точная транслитерация латинского g перед e (как в слове genius). В XIX веке такое написание встречалось в учебных заведениях, где латынь преподавали с классическим произношением. В бытовой русской речи слово «гений» писали и произносили с мягким «г», поэтому фамилия могла бы звучать как Гениусов. Вариант Джениусов — более архаичный и учёный, он указывает на книжное, а не устное происхождение.

Поскольку фамилия очень редкая и не массовая, её носители, скорее всего, происходят из узкого круга — потомков духовенства или разночинцев, получивших образование в латинских школах. Сословная принадлежность могла быть любой, от священников до мелких чиновников, но география бытования, скорее всего, связана с крупными городами или семинарскими центрами (Москва, Санкт-Петербург, Киев). Точных данных о распространении фамилии Джениусов в открытых источниках мало, что подтверждает её исключительность.