Фамилия Эчко — редкий случай, когда географический указатель «работает» сильнее, чем корень. Сама основа — Эч- — короткая и неочевидная, но суффикс -ко сразу выдает украинское или белорусское происхождение. В восточнославянской ономастике суффикс -ко (уменьшительно-ласкательный или патронимический) чаще всего присоединяли к личным именам и прозвищам: Ивашко, Петько, Федько. Эчко, скорее всего, стоит в том же ряду.

Главная загадка — что за имя или прозвище лежит в основе. Самая прямая версия: Эчко — это украинская или белорусская форма от имени Ефим (разговорное Ехим, Ехимко, которое могло дать Эчко через чередование х/ч). Вторая версия, менее очевидная, но возможная: основа от тюркского эч («ничто», «ничего»). В южнорусских и казачьих говорах такое прозвище могли дать неимущему человеку — «гол как сокол», «ни кола ни двора». В пользу этой гипотезы говорит то, что фамилии с тюркскими корнями на -ко встречаются в зонах активных контактов славян и кочевников (Запорожье, Слобожанщина).

Третья версия, самая прозаичная: фамилия могла возникнуть от названия реки или урочища. В бассейне Днепра есть несколько мелких речушек с корнем Эч- (например, Эч — приток Северского Донца). Тогда Эчко — это прозвище человека, жившего на такой реке, а фамилия закрепилась по месту жительства.

Суффикс -ко в украинской традиции часто указывал на молодого человека, сына: Эчко буквально — «маленький Эч» или «сын Эча». Со временем это прозвище закрепилось за родом и перестало осознаваться как уменьшительное. В сословном плане носители фамилии, скорее всего, относились к казачеству или крестьянству — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

В современных базах данных фамилия Эчко встречается точечно, в основном на юге России (Краснодарский край, Ростовская область) и на востоке Украины. Это подтверждает версию о её запорожском или слобожанском происхождении. Фамилия не получила массового распространения, поэтому её носители — почти наверняка потомки одного или нескольких небольших родов.