Фамилия Ефретова — женская форма, а её мужской вариант — Ефретов. В основе лежит имя или прозвище Ефрет, которое, скорее всего, является фонетическим вариантом канонического имени Ефрем. В народной речи, особенно в диалектах, где «м» перед «т» могло переходить в «ф» или упрощаться, имя Ефрем нередко звучало как Ефрет. Так появилось прозвище или обиходная форма, от которой и пошла фамилия.

Модель образования простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ов- (в женском роде -ова) присоединился к основе Ефрет. Такая фамилия указывала на принадлежность к главе семьи — «сын Ефрета» или «внук Ефрета». Встречается она в основном в центральной России и Поволжье, где имя Ефрем было распространено в крестьянской и мещанской среде.

Само имя Ефрем — древнееврейского происхождения, означает «плодовитый». В христианской традиции его носил один из отцов церкви, преподобный Ефрем Сирин. Так что фамилия Ефретова, хотя и через народную переделку, восходит к этому же имени, но с характерным «простонародным» звуковым обликом. Редкий случай, когда фамилия сохранила не книжную, а разговорную форму имени, что делает её ценной для историков языка.

Если искать аналоги, то это фамилии вроде Ефремов (от полной формы) или Ефремычев (от уменьшительной). Ефретова стоит в том же ряду, но с более заметным фонетическим сдвигом. Сословно предки носителей этой фамилии — скорее всего, крестьяне или посадские люди, у которых имя Ефрем бытовало в обиходе именно в такой огласовке.