Фамилия Екубова — женская форма фамилии Екубов, а та в свою очередь образована от имени Екуб. Это один из вариантов арабского имени Якуб (библейский Иаков), которое через тюркские языки вошло в обиход многих народов России. Приставка «Е-» вместо «Я-» — характерная черта для ряда тюркских диалектов, особенно в Средней Азии и среди казанских татар, где звук «я» в начале слова часто переходит в «е». Так что Екубов — это тот же Якубов, но с местным произношением.

Модель фамилии простая: основа (имя Екуб) плюс патронимический суффикс -ов/-ев, указывающий на принадлежность к роду: «сын Екуба». В русской традиции такие фамилии закрепились у крещёных татар, башкир, а также у народов Кавказа, где ислам соседствовал с русским административным учётом. Встречается фамилия и у осетин, и у азербайджанцев — везде, где имя Якуб было распространено, а местный говор смягчал начальный звук.

Интересно, что фамилия Екубова не так частотна, как её «полный» аналог Якубов. Это говорит о том, что предки носителей, вероятно, жили в изолированной языковой среде, где диалектная норма закрепилась в документах. В метрических книгах XIX века по Казанской и Оренбургской губерниям можно найти записи именно с таким написанием — это указывает на татарское или башкирское происхождение.

Если же говорить о значении имени Якуб (Екуб), оно восходит к древнееврейскому корню со значением «идти по следу» или «держаться за пятку» — по библейской легенде, Иаков родился, держась за пятку брата-близнеца. Но для рядового носителя фамилии это уже не имело значения: имя просто передавалось по мужской линии, пока не стало наследственным родовым прозвищем.