Фамилия Элифханова — редкий пример фамилии, образованной от арабского личного имени с тюркским суффиксом принадлежности. Её основа восходит к мужскому имени Элифхан, которое составное: первая часть «Элиф» (араб. أَلِف — «алиф», первая буква арабского алфавита, символизирующая начало, единого Бога) часто входит в мусульманские имена как указание на божественное. Вторая часть «хан» (тюрк. «властелин, правитель») — традиционный компонент имён у народов, испытавших тюркское влияние. Вместе имя можно прочитать как «правитель, подобный началу» или «владыка, отмеченный алифом», но скорее всего это просто благозвучное составное имя, где «хан» подчёркивает высокий статус.

Фамилия образована по русской модели: к основе Элифхан добавлен суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Такая модель типична для фамилий, которые в XIX–XX веках фиксировались в метрических книгах и паспортах у народов Кавказа и Поволжья, исповедующих ислам. Мужской вариант — Элифханов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Элифханов, то есть сын (или потомок) Элифхана. Окончание -а в женском варианте — результат грамматической русификации, когда фамилия склоняется как прилагательное.

Географически фамилия Элифханова почти наверняка связана с Дагестаном, Чечнёй или Ингушетией, реже — с татарской или башкирской средой. Имя Элифхан встречается именно в этих регионах, особенно у кумыков и чеченцев. В дореволюционных записях фамилия могла писаться как Элипханова или Алипханова (через «а»), поскольку звук «э» в начале слова не был привычным для русского уха. Такая вариативность — обычное дело при переходе устной мусульманской традиции в письменные документы на русском языке.

Социальный контекст: носители фамилии вряд ли принадлежали к высшей аристократии, так как составные имена с «хан» у горцев Северного Кавказа давали не только знати, но и просто уважаемым людям. Скорее всего, предок Элифхан был зажиточным крестьянином, старшиной села или мелким землевладельцем. Фамилия не получила широкого распространения, что говорит о её локальном, возможно, даже одноаульном происхождении.

В отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я), вариант Элифханова сохраняет редкое сочетание: арабский корень, тюркский титул и русский суффикс — три культурных слоя в одной фамилии. Это делает её характерным маркером тех регионов, где ислам, тюркские языки и русская административная система пересекались особенно плотно.