Фамилия Ельмуратов — редкий случай, когда тюркское имя-основа соединилось с русским патронимическим суффиксом -ов. Вопреки распространённому мнению, эта фамилия не обязательно восходит к единому корню: здесь возможны две версии, и обе имеют право на существование.

Первая и самая вероятная версия — от тюркского мужского имени Ельмурат. Оно составное: «ель» (или «ил») означает «родина», «страна», «народ», а «мурат» (арабского происхождения) — «желанный», «цель», «стремление». В сумме имя переводится как «желанный для народа» или «цель народа». Такое имя было распространено у многих тюркских народов — от татар до казахов и башкир. Суффикс -ов сделал из этого имени фамилию по стандартной русской модели: Ельмурат → Ельмуратов, то есть «сын Ельмурата».

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с каракалпакским или ногайским именем Ельмурат (встречается и в форме Йылмурат), где «йыл» — «год», «время», «судьба». Тогда значение смещается к «желанный в этом году» или «долгожданный». Спор между версиями не принципиален: в обоих случаях фамилия указывает на то, что предок носил личное имя с пожелательной семантикой.

Географически фамилия Ельмуратов встречается главным образом в Поволжье (Татарстан, Башкортостан), в Оренбургской области, а также в Казахстане и Узбекистане. Это типичная фамилия для татарской и башкирской среды, реже — для казахов. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми — в XVII–XIX веках многие тюркские имена фиксировались в документах при переходе на русскую модель фамилии.

Интересная деталь: в русском языке фамилия сохранила начальное «Е», хотя в тюркских оригиналах часто встречается «И» (Ильмуратов). Это следствие адаптации через письменные источники — при записи в метриках или ревизских сказках звук мог передаваться как «е». Поэтому однофамильцы с разным написанием (Ельмуратов и Ильмуратов) могут быть прямыми родственниками, разошедшимися в документах из-за диалекта писаря.