Фамилия Ельтинских — яркий образец северорусской модели фамилий на -их/-ых, распространённой в бывших новгородских землях, на Урале и в Сибири. Такие фамилии указывали на принадлежность к дому или роду: Ельтинских — «из семьи Ельтина». В отличие от центральной России, где закрепились формы на -ов/-ин, на Русском Севере долго сохраняли архаичную форму родительного падежа множественного числа, и она стала наследственной.

Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Ельтя (Ельтин — его притяжательная форма). Скорее всего, оно связано с елью: человека могли прозвать за высокий рост, худощавость или за то, что жил в еловом лесу. В русских говорах слово «ель» имело и переносные значения — например, «елкой» называли бестолкового или упрямого человека. Менее вероятна связь с диалектным «ельте́нь» (лень, неповоротливость) — это слово встречается редко и локально.

Суффикс -ин в основе Ельтин — обычный для русских фамилий показатель принадлежности («чей?»). Получается цепочка: Ельтя → Ельтин сын → Ельтин → Ельтинские (семья) → Ельтинских. Такой тип фамилий редко встречается за пределами северных регионов, поэтому носители фамилии Ельтинских с высокой вероятностью имеют корни в Архангельской, Вологодской, Вятской губерниях или в Пермском крае.

Сословно фамилия не элитарная: на -их/-ых обычно закреплялись у крестьян и мещан, реже — у купцов. В дореволюционных переписях Ельтинских могли записать как Ельтиных или Ельтинских — в зависимости от грамотности писаря и местной традиции. Встречаются и однокоренные фамилии: Ельтинов, Ельтягин, Елькин.

Точных сведений о первых носителях нет, но понятно, что предок нынешних Ельтинских жил в лесной полосе, возможно, промышлял рубкой или сплавом ели. Сама фамилия звучит архаично и сразу выдаёт северное происхождение — таких в русском ономастиконе осталось немного.