Фамилия Емельчиков — один из тех случаев, когда за привычным суффиксом -ов скрывается нестандартная основа. В подавляющем большинстве русских фамилий на -ов мы видим прямое притяжательное значение: «чей?» → «сын такого-то». Здесь же всё сложнее: основа не имя Емельян, а его производная форма Емельчик.

Разберём цепочку. Полное крестильное имя Емельян (от греческого «аймилиос» — ласковый, льстивый) в народной речи сократили до Емеля, а затем добавили уменьшительный суффикс -чик. Так появилось прозвище или домашнее имя Емельчик — ласковое обращение к человеку по имени Емельян. Фамилия Емельчиков, таким образом, означает не «сын Емельяна», а «сын Емельчика», то есть потомок того, кого в семье называли этой уменьшительной формой.

Модель образования здесь редкая. Обычно от имён на -а (Емеля, Кузьма, Фома) фамилии образовывали с суффиксом -ин: Емелин, Кузьмин, Фомин. Суффикс -ов в фамилии Емельчиков указывает на то, что основа (Емельчик) воспринималась как слово мужского рода с нулевым окончанием — по той же логике, по которой от прозвища Молчун получилась фамилия Молчунов.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России. Встречается в Воронежской, Тамбовской, Рязанской областях — именно там уменьшительные формы на -чик были особенно распространены в быту. По сословной принадлежности Емельчиковы, скорее всего, крестьяне или однодворцы: в дворянских родословных книгах эта фамилия не фиксируется, а в ревизских сказках XIX века встречается именно в среде государственных и помещичьих крестьян.

В написании фамилии возможна путаница с вариантом Емельщиков (через «щ»). Это разные фамилии: Емельщиков образован от слова «емельщик» — так в некоторых говорах называли человека, который занимался выделкой кож или дёгтя (от диалектного «емель» — кожаный мешок). Но для фамилии Емельчиков такая версия маловероятна: суффикс -чик в основе указывает именно на личное имя, а не на профессию.