Фамилия Еминен — редкий случай, когда в основе лежит не русское имя или прозвище, а прибалтийско-финская модель фамилии. Чтобы разобраться, нужно отвлечься от привычной схемы «Иван — Иванов» и посмотреть на северо-запад.

Фамилия образована от личного имени Еми или Емине с помощью типичного для карельского, вепсского и финского языков суффикса -нен. В прибалтийско-финской ономастике этот суффикс означает «родом из», «принадлежащий к», то есть Еминен — буквально «из рода Еми». По-русски это звучало бы как «Емины» или «Емичи», но грамматически устроено иначе.

Само имя Еми — это, скорее всего, сокращённая форма от крестильного имени Еремей (древнееврейское Иеремия, «возвышенный Богом») или от Емельян (от латинского Aemilianus — «соперник»). В карельской и финской среде полные имена часто усекали до одного-двух слогов, а потом добавляли фамильный суффикс. Так появились десятки фамилий на -нен: Микконен, Хейккинен, и Еминен — из того же ряда.

Географически фамилия тяготеет к территориям бывшей Олонецкой губернии и Карельского перешейка, где веками жили карелы и ингерманландские финны. После переселений XIX — начала XX века часть носителей оказалась в Тверской и Ленинградской областях. В центральных русских губерниях эта фамилия не встречалась — её принесли уже в советское время мигранты.

Версия о том, что Еминен — это искажённое Емельянов или Ерёмин, маловероятна. Русские фамилии на -ин и -ов образуются по другой модели, и замена суффикса на -нен без переезда в финно-угорскую среду необъяснима. Так что предки носителя этой фамилии с высокой вероятностью были не крестьянами центральной России, а карелами или финнами-лютеранами, жившими общинами на севере.