Фамилия Емщинин — редкий пример отчества сразу третьей степени, или «внучьего» имени. Цепочка выстраивается так: сначала было личное прозвище Емща, затем — отчество Емщин («чей?» — сын Емщи), и уже от него, с помощью суффикса -ин, образовалась фамилия Емщинин («внук Емщи» или «дочь Емщина»). Такая модель встречается нечасто и обычно указывает на то, что прозвище закрепилось в семье очень прочно.

Корень здесь — глагол «емать», который В. И. Даль фиксирует в значении «брать, взять», а также «собирать, взымать» и даже «схватиться, бороться». Отсюда первая и самая прямая версия: прозвище Емща мог получить сборщик податей или налогов — человек, который «емал» (взыскивал) оброк или пошлины. В говорах действительно бытовало однокоренное слово «емак» — съемщик, откупщик, арендатор, что подтверждает хозяйственно-административный оттенок прозвища.

Но глагол «емать» имел и переносный смысл — «связываться, схватиться». Поэтому не исключено, что прозвище Емща дали человеку вспыльчивому, несдержанному, склонному к ссорам и дракам. В русской ономастике такие «характерные» прозвища встречаются сплошь и рядом, и второе значение корня не менее вероятно.

Суффикс -ща в основе Емща — редкий, он мог передавать как уменьшительность, так и пренебрежительность, но в данном случае, скорее всего, просто образовывал прозвище от глагольной основы. Фамилия Емщинин не имеет географической привязки в известных справочниках, но по модели образования и корню её можно отнести к севернорусским или центральным областям, где отчества на -ин особенно распространены.

Таким образом, Емщинины — потомки либо сборщика податей, откупщика или арендатора, либо человека с крутым нравом, который «емался» (сцеплялся, брался) с каждым встречным. Оба варианта правдоподобны, и выбрать между ними без дополнительных исторических записей конкретной семьи невозможно.