Фамилия Енбахтова — редкая, и её разбор сразу упирается в географию. Скорее всего, это русская фамилия, но с нерусским корнем. Основа «Енбахт» явно тюркского происхождения. В татарском и башкирском языках «ян» (йән) — душа, а «бахт» — счастье, доля. Вместе «янбахт» или «йәнбахт» означает «счастливая душа» или «душа-счастье». Такие составные имена (Янбахт, Енбахт) давали с пожеланием счастливой судьбы. Фамилию образовали от этого имени, добавив русский суффикс принадлежности -ов. Форма Енбахтова — женская, мужской вариант — Енбахтов.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия сложилась в русской среде, скорее всего, в среде крещёных татар или башкир, которые переходили на русские фамильные модели. Это типичная «фамилия второго уровня»: сначала было личное имя Енбахт, потом от него образовали отчество (Енбахтов сын), а затем оно закрепилось как фамилия. Носителей фамилии немного, но она встречается в Поволжье и на Урале — в регионах, где исторически жили татары и башкиры.

Написание с буквой «Е» в начале (вместо «Й» или «Я») — ещё один признак русификации: звук «йэ» или «йа» на письме передали как «е», что часто делали в документах XIX — начала XX века. Поэтому фамилию стоит записывать как Енбахтова, но произносить с мягким началом. Никаких других версий — от географических названий или профессий — для этого корня не существует. Спорных гипотез здесь просто нет: основа прозрачна, а суффиксальная модель стандартна.