Фамилия Эндебери — редкий случай для русского ономастикона, и её происхождение почти наверняка не связано со славянскими корнями. С первого взгляда она напоминает топонимические фамилии на -и, характерные для польской или белорусской традиции (типа Подбереский, Забережный), но основа «Энде-» здесь совершенно инородна. Вероятнее всего, перед нами вариант передачи иностранной фамилии — скорее всего, английской или немецкой, адаптированной кириллицей. В английском языке существует фамилия Endebury, которая восходит к названию местности: древнеанглийское ende (конец, край) и burh (укреплённое поселение, город). Носитель такой фамилии в Англии мог быть выходцем из деревни, стоявшей на краю владений или у границы. В русском контексте фамилия Эндебери могла появиться у обрусевших потомков иностранных специалистов (например, инженеров или врачей), приехавших в Российскую империю в XVIII–XIX веках, или у выходцев из Прибалтики, где немецкое дворянство нередко носило подобные фамилии. Славянского суффикса в ней нет — окончание -и выполняет чисто графическую роль, передавая звучание оригинала. Встречаемость фамилии в современных российских базах крайне низкая, что подтверждает её недавнее заимствование и узкую географию. Если ваш предок носил эту фамилию, стоит искать его корни не в крестьянской среде центральной России, а в городских сословиях или среди иностранных колонистов, например, в Поволжье или Петербурге.