Фамилия Енейкин — из тех, что хранят в себе древнее имя, сегодня почти забытое. В её основе лежит крестильное имя Еней — народная форма канонического имени Еней (Эней). В святцы это имя попало из античной мифологии: так звали легендарного троянского героя, родоначальника римлян. В русской традиции имя Еней встречалось редко, но устойчиво, особенно в среде духовенства и купечества, где любили редкие «учёные» имена.

Модель образования проста и типична: суффикс -ин указывает на принадлежность. Енейкин буквально значит «сын Енея» или «человек из рода Енея». Обычно такие фамилии закреплялись за детьми, внуками или слугами того, кого звали Еней. Судя по суффиксу, фамилия сформировалась не в великорусских центральных землях (где преобладал -ов), а скорее в северных или поволжских регионах, где -ин был нормой.

Интересно, что имя Еней не путать с тюркским Еней (от «мать»). В русском контексте оно книжного, церковнославянского происхождения. Поэтому предок носителя фамилии был, скорее всего, грамотным человеком — священником, дьячком или купцом, который дал сыну имя в честь античного героя. Фамилия осталась редкой, не размножилась по крестьянским дворам, и сегодня её носители — потомки тех немногих родов, где имя Еней передавалось из поколения в поколение.

Встречается Енейкин преимущественно в центральной России и Поволжье. Поскольку фамилия не массовая, её географию можно проследить по архивным записям XIX века: единичные семьи в Рязанской, Тамбовской и Нижегородской губерниях. Никаких знаменитых носителей в истории не зафиксировано — фамилия осталась тихой, домашней, без громких страниц.