Фамилия Енгеевы — редкий случай, когда тюркская родственная терминология легла в основу родового имени. Вопреки частому мнению, что такие прозвища давали по профессии или внешности, здесь мы видим обозначение свойства: «Енге» (от узбекского yenga или казахского jeñge) означает «невестка, жена старшего брата или родственника». То есть прозвище мог получить человек, находившийся в таком родственном положении, или, что вероятнее, так в шутку или по обычаю называли мальчика, воспитывавшегося в доме старшего брата.

Модель образования типична для тюркских фамилий, русифицированных суффиксом -ев: основа «Енге» + фамильный суффикс. Фамилия закрепилась в формах Енгеев и Енгеевы, причем вторая — это традиционная русская форма множественного числа, указывающая на весь род.

Встречается и гипотеза о немецком корне Enge («долина, ущелье»), но она слабее: во-первых, для русских фамилий немецкие заимствования такого типа редки и обычно связаны с переселенцами, а во-вторых, тюркская версия объясняет и географию бытования фамилии (Поволжье, Урал, Средняя Азия).

Точное время возникновения фамилии Енгеевы установить сложно, но сам факт, что в основе лежит не имя, а термин родства, делает её ценным памятником восточной семейной культуры, где такие прозвища были частью бытового этикета.