Фамилия Эннговатов — редкий случай, когда написание почти полностью выдает географическое происхождение носителя. Двойное «нн» и буква «э» в начале — верный признак того, что перед нами не исконно русская фамилия, а русифицированная версия фамилии тюркского или кавказского корня. С высокой вероятностью, основа восходит к личному имени или прозвищу Эннга, Энга или Анга. В тюркских языках корень «ан» или «эн» может означать «зверь», «дичь» (например, в казахском «аң» — зверь), а также фигурировать в составе сложных имен со значением «широкий», «просторный». Удвоение «н» в русской записи — это либо попытка передать долгий или напряженный согласный звук исходного языка, либо результат позднейшего искажения при переписи населения.

Суффикс «-оват» в русских фамилиях нетипичен. Обычная модель — «-ов» (Эннгов) или «-ев» (Эннгаев). Форма на «-оватов» встречается в основном в тех случаях, когда исходное имя или прозвище уже имело на конце «-оват» (например, от прозвища Эннговатый — «тот, кто похож на Эннгу» или «происходящий от Эннги»). Другое объяснение — это результат сращения фамилии с патронимическим суффиксом при переносе из другой языковой среды. Например, в некоторых тюркских языках есть аффикс «-ат» со значением множественности или принадлежности, который при русификации мог превратиться в «-оват».

Географически фамилия тяготеет к югу России, особенно к Астраханской области, Калмыкии и Ставрополью. Именно в этих регионах исторически фиксировались фамилии с похожей «двойной» структурой — результат смешения тюркских, монгольских и славянских именных традиций. Вероятнее всего, предок носителя фамилии Эннговатов был крещеным калмыком, татарином или ногайцем, получившим фамилию по отцу или по прозвищу в XIX веке, когда массово закреплялись фамилии за инородческим населением.

Социальный состав таких фамилий чаще всего был крестьянским или казачьим. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В дореволюционных метрических книгах Эннговатовы встречаются редко, что подтверждает ее локальный и поздний характер. Сегодня эта фамилия остается крайне малочисленной, что делает ее ценным маркером для генеалогического поиска — каждый носитель, скорее всего, происходит из узкого круга родственных семей, живших в одном или соседних селах.