Фамилия Енсепбаева образована от мужского имени Енсепбай. Это составное тюркское имя, распространённое у казахов. Первая часть — «енсеп» — восходит к арабскому слову «инсаф» (справедливость, совесть). В казахском языке «енсеп» означает «честный», «добросовестный». Вторая часть — «бай» — традиционный титул, означающий «богач», «хозяин», «господин». Таким образом, имя Енсепбай можно перевести как «честный богач» или «справедливый хозяин». Это имя давали с пожеланием, чтобы мальчик вырос состоятельным и порядочным человеком.

Фамилия Енсепбаева — женская форма. Мужской вариант — Енсепбаев. Оба образованы по русской модели: к основе имени Енсепбай добавили суффикс -ев (вместо тюркского окончания -бай) и окончание -а для женского рода. Такая схема типична для тюркских фамилий, которые адаптировали в Российской империи и СССР: корень имени, суффикс принадлежности, окончание рода.

По географии фамилия почти исключительно казахская. Носители живут в Казахстане, особенно в южных и западных областях (Кызылординская, Мангистауская, Актюбинская), встречается и среди казахов в России (Астраханская, Оренбургская области). В дореволюционную эпоху фамилию могли закрепить за родом в конце XIX — начале XX века, когда казахам начали массово присваивать фамилии по отцу. Предки носителей фамилии были скотоводами или земледельцами, а имя Енсепбай указывает на уважаемого в ауле человека — не обязательно богатого, но честного и справедливого.

С точки зрения словообразования интересна первая часть: «енсеп» — это не просто арабизм, а адаптированное через персидский язык слово, которое в казахском языке приобрело оттенок «добросовестный», «честный в делах». Это редкий случай, когда в основе фамилии лежит не имя или прозвище, а прямое моральное качество. Другие однокоренные фамилии (Инсафов, Енсепов) встречаются реже, что делает Енсепбаева более узнаваемой.