Фамилия Енуковы (в мужском роде — Енуков) принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от личного имени. Основа здесь — имя Енук, которое ономасты выводят из двух разных источников. Первая и более вероятная версия: Енук — это краткая, разговорная форма крестильного имени Евникиан. Имя Евникиан греческого происхождения, в переводе означает «добропорядочный». Вторая версия связывает фамилию с татарским именем Еникей, которое переводится как «душа моя». Если принять эту гипотезу, то можно предположить, что Енуком назвали долгожданного ребёнка.

Словообразовательная модель типична: к основе Енук добавили русский патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Енуков сын). Со временем это отчество закрепилось как фамилия. О точном месте и времени возникновения фамилии Енуков сейчас говорить сложно — процесс становления фамилий шёл постепенно. Однако сама фамилия — яркий пример того, как церковное имя, пройдя через народную переделку, дало жизнь новой родовой ветви.