Фамилия Енышевская принадлежит к распространённому типу польских и западнорусских фамилий с суффиксом -ский/-ская. Такая модель указывала на дворянское или шляхетское происхождение: в Речи Посполитой суффикс -ский закрепился за землевладельцами, которые брали фамилию по названию родового имения. В русских губерниях этот суффикс тоже связывали с привилегированным сословием, хотя со временем фамилии на -ский получили и крестьяне, и духовенство.

Основа фамилии — корень Еныш-. Скорее всего, это топонимическое прозвище: Енышевская — та, что родом из населённого пункта Енышево или Еныш. Такие названия встречаются в Поволжье и на Урале. Например, в Татарстане есть село Енышево, а в Марий Эл — деревня Енышево. Эти топонимы, в свою очередь, восходят к тюркскому личному имени Еныш (вариант Яныш, что значит «новый», «молодой»). В русских говорах имя Еныш могло закрепиться как прозвище человека, пришлого или младшего в роду.

Мужская форма — Енышевский. Встречается она редко: по открытым данным, носителей фамилии Енышевская в России не больше нескольких десятков, и сосредоточены они преимущественно в Республике Марий Эл и соседних регионах. Это подтверждает версию о локальном, «гнездовом» происхождении фамилии.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Енышев, Еныгин, Янышев) показывает, что Енышевская — более поздняя, «облагораживающая» форма. В XVII–XIX веках крестьяне и мещане, переселяясь в города или получая чин, нередко меняли окончание фамилии с -ов на -ский, чтобы звучать «благороднее». Так что предки Енышевской могли быть крестьянами из марийского или татарского села Енышево, которые при переписи или поступлении на службу «удлинили» фамилию по польскому образцу.