Фамилия Енюхина — женская форма фамилии Енюхин, которая образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от имени или прозвища с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность — буквально «чей?» — «сын Енюхи» или «внук Енюхи». Основа здесь — Енюха, и это ключ к происхождению.

Енюха — это просторечная, уменьшительно-ласкательная форма от канонического крестильного имени Евфимий. Евфимий (греч. «благочестивый», «доброжелательный») в народной русской речи дал множество производных: Ефим, Ефимка, Ефимушка, а также Енюша, Енюха. Переход «ф» в «н» — типичное явление для диалектного произношения (ср. «конверт» вместо «конверт» или «Ефим» — «Еним»). Так что Енюхин — это «Ефимов сын», только в более разговорной, «домашней» форме.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с древнерусским нецерковным именем Еня. В старину такие имена давали по внешним признакам или поведению. Однако в случае с Енюхиным первая гипотеза надёжнее: фамилия имеет чёткую параллель с десятками других русских фамилий на -ихин/-ухин от имён Евфимий (Ефимов, Ефимочкин, Енюшин).

Географически фамилия Енюхин (и Енюхина) встречается преимущественно в центральных и южных регионах России — в Воронежской, Тамбовской, Рязанской областях, а также в Поволжье. Это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия: она не указывает на знатное происхождение, но говорит о том, что предки были людьми вольными или государственными крестьянами, носившими обиходное имя Енюха.

С точки зрения словообразования фамилия примечательна тем, что сохранила архаичную форму с суффиксом -ин, который в современном русском языке реже используется для образования фамилий от имён на -а (сравните: Енюхин, а не Енюхов). Это делает её «живым» свидетельством народной речи XVIII–XIX веков.