Фамилия Эпнер, вероятно, является фонетическим вариантом фамилии Хепнер (Hepner). В ее основе лежит аналогичное прозвище. Можно предположить, что оно происходит от немецкого слова Hepe – «изогнутый нож для отрезания винограда от лозы». Скорее всего, прозвище Хепнер получил тот, кто работал на винограднике или занимался изготовлением таких ножей. Соответственно, данное прозвище относятся к числу так называемых «профессиональных» именований, указывающих на род занятий предка.