Фамилия Ермышкина — женская форма, мужской вариант — Ермышкин. В основе фамилии лежит имя или прозвище Ермышка. Это не случайное сочетание звуков, а уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Ермолай. Имя Ермолай греческого происхождения, в переводе — «вестник народа» (от «ермо» — вестник и «лаос» — народ). В русской народной среде имя переделали на свой лад: Ермолай превращался в Ермошку, Ермолку, а форма Ермышка — одна из самых редких и специфичных.

Суффикс «-ышк-» в русском языке характерен для ласкательных, а иногда и пренебрежительных прозвищ. Сравните: Иванишка, Фомишка. Такие формы чаще всего возникали в северных и центральных говорах, где было принято «окать» и смягчать окончания. Фамилия Ермышкин, скорее всего, сформировалась не от официального имени, а от обиходного уличного прозвища, которое закрепилось за главой семьи. В этом её отличие от более распространённых Ермолаевых или Ермоловых — она указывает на конкретную, локальную манеру именования.

Географически фамилия редкая. Её следы встречаются в основном в Поволжье и на Урале, где в XVII–XIX веках селились выходцы из северных губерний. Если верить разрозненным данным переписей, Ермышкины — это бывшие государственные крестьяне или однодворцы. Никакой связи с дворянскими родами или известными историческими личностями у фамилии нет: она чисто народная, крестьянская.

Словообразовательная модель проста: основа Ермышк- + фамильный суффикс -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Ермышкин, то есть сын Ермышки. Такие фамилии типичны для центра и севера России. Южнее и в Белоруссии чаще использовали суффикс -ов/-ев, поэтому Ермышкин — однозначно северорусский или среднерусский вариант.

В написании фамилии иногда встречается путаница: Ермышкина могут записать как Ермишкина, что ближе к литературному произношению (через «и»). Но исходная форма с «ы» — архаичная, диалектная, и именно она представляет наибольшую ценность для этимолога, так как сохраняет живую народную речь.