Фамилия Ешмуханова — яркий пример тюркской антропонимии, где за звучанием стоит сложный культурный сплав. Её основа — составное имя, и у исследователей есть на этот счёт две основные версии, обе по-своему интересны.

Первая версия отталкивается от киргизского слова «эшме». В буквальном переводе оно означает «идущий крутыми изгибами» — так могли назвать извилистую реку или трудную дорогу. Вряд ли это прямое прозвище человека, скорее, за этим корнем стоит более древнее, возможно, топонимическое прозвище.

Вторая версия выглядит убедительнее и встречается чаще. Она разбивает первую часть имени «Ешму» на два компонента: узбекское «эш» («товарищ, друг») и усечённую форму имени Мухаммед («прославляемый»). Таким образом, Ешму — это «друг Мухаммеда», то есть имя, данное в честь пророка или с пожеланием божественного покровительства. Такая модель образования имён (смысловая часть + сакральное имя) типична для исламизированных тюркских народов.

Вторая часть фамилии — «хан» — сомнений не вызывает. Восходит она к древнетюркскому «хаган», «каган» — «властитель, монарх». Первоначально так называли вождя племени, особенно у кочевников Ирана и Афганистана, но со временем слово превратилось в почётный компонент имени, указывающий на знатность рода или просто на уважение к носителю.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, который в данном случае присоединился к основе Ешмухан. Суффикс указывает на принадлежность: Ешмуханов — «сын Ешмухана» или «из рода Ешмухана». Окончание -а — женская форма фамилии. Процесс закрепления таких фамилий у тюркских народов шёл долго, поэтому точно определить место и время возникновения рода Ешмухановых можно только по генеалогическим записям, но ясно, что корни фамилии — в среде, где переплелись тюркские языки и исламская культура.