Фамилия Ермуханова — женская форма от мужской фамилии Ермуханов. Это типичная фамилия тюркского происхождения, распространённая у казахов, татар и башкир. Её основа — составное мужское имя Ермухан, которое в тюркских языках складывается из двух частей: «ер» или «ир» (мужчина, герой, смелый) и «мухан» (вариант арабского имени Мухаммад — «восхваляемый», «достойный хвалы»). Таким образом, имя Ермухан можно перевести как «доблестный Мухаммад» или «герой, подобный Мухаммаду».

Суффикс -ов (-ова) в этой фамилии — не исконно тюркский, а русский патронимический формант, который добавили при оформлении фамилий в документах Российской империи. В казахской среде, где фамилии как таковые закреплялись поздно (в основном в XIX — начале XX века), к отцовскому имени добавляли русское окончание, чтобы подогнать под стандарт метрических книг и переписей. Поэтому Ермуханова буквально означает «принадлежащая роду Ермухана» или «дочь/жена Ермухана».

Географически фамилия чаще всего встречается в Казахстане, особенно в северных и центральных областях, а также среди татарского населения Поволжья и Приуралья. У башкир встречается вариант Ермухаметов — от того же корня, но с более полной формой имени.

В отличие от многих русских фамилий, которые произошли от прозвищ или профессий, Ермуханова напрямую восходит к личному имени, что указывает на относительно позднее формирование и патриархальный уклад: человека называли по отцу, а не по роду занятий. Имя Ермухан не было редким, поэтому однофамильцы могут не состоять в близком родстве — просто в разных аулах жили разные Ермуханы, чьи потомки получили одинаковую фамилию.

С точки зрения ономастики, фамилия интересна тем, что совмещает арабский религиозный компонент (Мухаммад) с тюркским светским (ер/ир). Это типично для исламизированных тюркских народов, где арабские имена переплетались с местными эпитетами.