Фамилия Есимканова — редкий случай, когда женская форма встречается чаще мужской, что указывает на её недавнее происхождение в русском контексте. Мужской вариант — Есимканов. В основе фамилии лежит тюркское мужское имя Есим, которое восходит к арабскому Исим (имя) или к казахскому Есим (память, ум). В казахской истории известно имя хана Есима, правившего в XVII веке, что делает фамилию потенциально связанной с почитанием предка или с прозвищем «умный, памятливый».

Суффикс -канов указывает на модель образования, характерную для фамилий народов Средней Азии и Казахстана. Компонент -кан (в русской передаче -хан) был титулом или уважительным обращением. Таким образом, Есимканов буквально означает «потомок Есим-хана» или «принадлежащий Есиму-хану». Окончание -а в женской форме — результат русификации: в русском языке фамилии на -ов/-ев в женском роде получают окончание -а.

Географически фамилия Есимканова распространена в Казахстане и среди казахов, проживающих в России (особенно в Оренбургской, Астраханской областях). Встречается она редко, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от названия конкретного рода или аула. В русских метрических книгах XIX века фамилия почти не фиксируется, что подтверждает её позднее закрепление в документах, когда казахи начали массово получать фамилии по отцу.

Спорных версий происхождения немного. Иногда корень Есим путают с русским именем Есей (Исай), но тюркская огласовка и суффикс -канов однозначно указывают на восточное происхождение. Вариант «от прозвища Есимка» (уменьшительное от Есим) возможен, но менее вероятен, так как суффикс -канов требует основы на -кан, а не на -ка.

Единственная деталь, которая выделяет фамилию среди подобных: она почти не имеет вариантов написания. В отличие от Есимханова или Есимова, форма Есимканова закрепилась без буквы «х» в середине, что может говорить о фонетическом упрощении в русской среде или о том, что имя Есим не воспринималось как составное с «ханом», а слилось воедино.