Фамилия Ескаирова — женская форма, а её мужской вариант — Ескаиров. Сразу бросается в глаза необычный финал: суффикс -ов- здесь присоединён к основе, которая не заканчивается на типичное русское окончание. Это верный признак фамилии тюркского или кавказского происхождения, скорее всего, из ареала распространения казахского, киргизского или башкирского языков.

В основе фамилии лежит личное имя Ескаир. Оно составное, что характерно для тюркской антропонимии. Первая часть «Ес» (или «Ис») восходит к слову «ис» — «разум, память, сознание». Вторая часть — «каир» (в тюркских языках «кайыр», «кайр») означает «милость, благосклонность, добро». Таким образом, имя Ескаир можно перевести как «милостивый разум», «добрая память» или «благосклонное сознание». Это имя-пожелание, которое родители давали ребёнку в надежде, что он вырастет рассудительным и добрым человеком.

То, что фамилия зафиксирована с суффиксом -ов (а не, скажем, -улы или -кызы), говорит о том, что её носители, вероятно, жили в регионах, где была сильна русская административная традиция оформления фамилий. Чаще всего такие фамилии встречаются среди казахов, башкир или татар, но могут быть и у других народов, входивших в состав Российской империи, где при переписях населения тюркские имена русифицировали по стандартной модели.

Встречаются также варианты написания с буквой «й» в середине — Ескайирова, что может быть следствием разного произношения в диалектах или ошибок писцов. Но исходная форма — через «а» — более точна, так как отражает звучание корня «каир».

Разобрать фамилию по сословному признаку сложно: имя Ескаир не было княжеским или аристократическим, но и не носило уничижительного оттенка. Скорее всего, предки носителя фамилии были свободными общинниками, скотоводами или земледельцами, получившими фамилию по имени отца при первой массовой паспортизации в XIX — начале XX века.