Фамилия Эскиндарова — женская форма фамилии Эскиндаров, и её происхождение напрямую связано с географическими названиями Кавказа. В основе лежит топоним Эскиндар или Эскиндар, который встречается в Дагестане и Чечне. Это название аула, села или урочища. Таким образом, Эскиндаров — это типичная «географическая» фамилия, указывающая на выходца из конкретного места: «Эскиндаров» буквально означает «из Эскиндара».

Модель образования проста и прозрачна. К основе Эскиндар- добавлен русский патронимический суффикс -ов, который в XIX–XX веках активно использовался для оформления фамилий у народов Северного Кавказа, особенно у кумыков, чеченцев и дагестанцев. Суффикс не несёт значения «сын» в прямом смысле, а выполняет функцию русификации и закрепления фамилии в документах. Женская форма Эскиндарова образована по стандартному правилу русского языка: добавлением окончания -а.

Сам топоним Эскиндар, скорее всего, тюркского или арабо-тюркского происхождения. Первая часть «эски» по-тюркски означает «старый», вторая — «индар» или «андар» может восходить к персидскому «андар» (внутри, среди) или быть искажением имени Искандер (Александр). В таком случае Эскиндар переводится как «Старый Искандер» или «Старая крепость», что типично для названий старых поселений на Кавказе. Встречаются параллельные написания: Эскиндаров, Эскендеров, Искандеров — все они восходят к одному корню, но различаются диалектным произношением.

Искать носителей фамилии стоит прежде всего в Дагестане, Чечне, а также в среде кумыкской диаспоры. Встречается она и в других регионах России, но всегда с кавказскими корнями. Социальный контекст прост: предки Эскиндаровых были горцами, земледельцами или скотоводами, а фамилия закрепилась за ними в ходе административного учёта в XIX — начале XX века.