Фамилия Естехин образована от имени Естеха — просторечной, разговорной формы канонического имени Евтихий. В русской традиции такие сокращённые варианты (Естеха, Евстюха, Естя) часто заменяли полное церковное имя в быту. Покровителем этого имени считается Евтихий Константинопольский — архиепископ, святитель. Святой Евтихий удалился в один из амасийских монастырей и принял монашество; за строгую жизнь он был поставлен архимандритом всех амасийских монастырей. Модель образования фамилии типична для русского Северо-Востока и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность «сын Естехи» или «из дома Естехи». Это отличает её от фамилий на -ов, которые чаще встречаются в южных и западных регионах. Таким образом, потомок человека по имени Естеха со временем получил фамилию Естехин. Встречается она преимущественно в старых переписях Вологодской и Костромской губерний, что подтверждает её севернорусское происхождение. В современном написании фамилия сохранила редкое сочетание «ст» в корне, что иногда приводит к ошибочной записи через «с» — Есехин, но исторически верная форма именно с «т».