Фамилия Евстюшина — женская форма фамилии Евстюшин, и её разумнее разбирать через мужской вариант. Корень здесь — редкое и неочевидное имя или прозвище. Фамилия образована с помощью суффикса -ин, который в русской ономастике традиционно присоединяли к основам на -а/-я, указывая на принадлежность: «чей сын?» — Евстюшин. Это говорит о том, что основатель рода носил имя или прозвище Евстюша.

Самое вероятное объяснение: Евстюша — это народная, разговорная форма канонического крестильного имени Евстафий (греч. «устойчивый», «хорошо стоящий»). В русской крестьянской и купеческой среде полные церковные имена часто усекали и добавляли уменьшительные суффиксы. Евстафий превращался в Евстюшу (как Евстафий — в Остапа, а Евстигней — в Евстюшу). Суффикс -юш- характерен для ласкательных прозвищ, поэтому фамилия могла означать «сын Евстюши», то есть человека, которого в быту звали ласково.

Менее распространённая, но допустимая версия: связь с редким именем Евстигней (греч. «благознаменный»). В некоторых говорах его тоже сокращали до Евстюши. Спор между этими гипотезами решается просто: Евстафий был гораздо более частым именем, чем Евстигней, поэтому первая версия правдоподобнее.

Интересная деталь: фамилия Евстюшин (и её женская форма) почти не встречается за пределами центральной России и Поволжья. В документах XVIII–XIX веков её носители — в основном государственные крестьяне и мещане. Ни в дворянских родословных книгах, ни в купеческих гильдиях эта фамилия не отмечена, что указывает на её простонародное, «низовое» происхождение. Суффикс -ин вместо более аристократичного -ов тоже подтверждает это: в крестьянской среде преобладала модель на -ин для основ на гласный.

Однокоренные фамилии — Евстюхин, Евстюшкин, Евстифеев — все они восходят к тому же корню, но с разными суффиксами. Евстюшина стоит особняком: она сохранила редкий уменьшительный вариант, почти исчезнувший в других фамилиях.