Фамилия Фафурина — женская форма фамилии Фафурин. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: с помощью суффикса -ин, который присоединяли к основам, оканчивающимся на -а, -я. Если мужчина был Фафурин, то его жена и дочери становились Фафуриными. В этом смысле фамилия типологически проста, но её корень — настоящая загадка.

Основа Фафур- в русских говорах не встречается ни как нарицательное слово, ни как распространённое прозвище. Скорее всего, перед нами звукоподражательное или междометное образование. В диалектах русского языка известно слово «фафа» — так в некоторых областях называли заикающегося человека или того, кто невнятно, «фафакает». Глагол «фафунить» (или «фафунять») мог означать «говорить неразборчиво, бормотать, мямлить». Если это так, то прозвище Фафура дали человеку с нечёткой речью, картавому или просто неразговорчивому. Подобные прозвища по физическим особенностям — один из древнейших пластов русских фамилий.

Есть и другая версия, менее вероятная, но любопытная. В некоторых говорах «фафура» — шутливое название поварёшки или ковша (от звука «фу-фу», которым сдувают пену). Тогда прозвище могло закрепиться за поваром или за тем, кто любил поесть. Однако эта гипотеза слабее, так как слово «фафура» в значении «утварь» не имеет широкого распространения и почти не фиксируется в письменных источниках.

Фамилия Фафурин — редкая. Она не встречается в боярских списках и не связана с известными дворянскими родами. По всей видимости, это крестьянская или посадская фамилия, возникшая в северных или центральных губерниях России, где диалектная лексика была особенно богата. Ономастические словари, например работы Б. Унбегауна, не выделяют Фафуриных в отдельную группу, что подтверждает её локальный и поздний характер.

Таким образом, Фафурина — фамилия-характеристика. Её носительницы происходят от предка, которого в деревне знали по особенности речи: он был «фафура» — неспешный, мямля или заика. Не самая лестная основа, но для русской ономастики это обычное дело: прозвища давали метко, без обид, и они закреплялись в роду на века.