Фамилия Фафурдинова — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а звукоподражательное прозвище. Скорее всего, предок человека с этой фамилией получил прозвище Фафурда или Фафурдя. В русских говорах глагол «фафурить» означал говорить невнятно, бормотать, мямлить, а «фафура» — это тот, кто говорит неразборчиво или капризничает. Таким образом, Фафурдинов — потомок человека, которого в деревне прозвали за манеру речи или за ворчливый нрав.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Фафурдинов, то есть сын или внук Фафурды. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Само прозвище Фафурда звучит необычно, но в ономастике есть параллели: например, фамилия Фафурин, тоже от «фафурить», или более известная Фефелов, связанная с глаголом «фефелить» (также о невнятной речи). Фафурдинов стоит в том же ряду, но с более редким суффиксальным оформлением.

Географически фамилия встречается в Поволжье, особенно в Татарстане и соседних областях, что наводит на мысль о возможном тюркском влиянии. В тюркских языках есть корень «фафур» (или «фафурда»), который может означать «пыхтеть», «сопеть» или «говорить с придыханием». Однако русская основа с глаголом «фафурить» выглядит более прямой и подтверждается диалектной лексикой. Тюркская версия — лишь гипотеза, так как фамилия записана в русском именослове и подчиняется русским словообразовательным законам.

Из-за редкости фамилии у неё нет широко известных носителей в истории или культуре. Это не умаляет её ценности: Фафурдиновы — потомки людей с ярким, запоминающимся прозвищем, которое, скорее всего, дали не со зла, а как меткую бытовую характеристику. В крестьянской среде такие прозвища часто закреплялись за целым родом, и со временем, после отмены крепостного права, превратились в официальные фамилии.