Фамилия Гаркунова — женская форма фамилии Гаркунов, которая образована от прозвища или нецерковного имени Гаркун. В основе лежит диалектный глагол «гаркать» — громко, резко кричать, издавать гортанный звук. В южнорусских и украинских говорах «гаркун» — это крикливый человек, горлопан, тот, кто говорит или поёт слишком громко. Реже так могли называть человека с хриплым, «гаркающим» голосом.

Суффикс -ун в русских прозвищах указывает на носителя действия: как хрипун (хрипящий) или говорун (говорящий), так и гаркун — тот, кто гаркает. Фамилия образована по стандартной патронимической модели: Гаркун → Гаркунов (чей сын?) → Гаркунова (его жена или дочь). Эта модель — самая распространённая в русской ономастике, она показывает, что основатель рода носил прозвище Гаркун.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. Встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях, а также на Кубани, куда переселенцы принесли южнорусские говоры. В письменных источниках XVII–XVIII веков можно найти упоминания гаркунов как казаков или крестьян, но массово фамилия закрепилась уже после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам.

Редкая особенность этой фамилии — сохранение конечного -а в основе. В большинстве фамилий на -ов женская форма выглядит как Гаркунова, но вариант Гаркунова (с ударением на второй слог) встречается реже. Если в документах ваших предков пишут именно Гаркунова, это может указывать на акающее произношение в говоре (когда «о» без ударения звучит как «а»). В любом случае, основа одна — прозвище крикливого или голосистого человека.

Сравните с однокоренными фамилиями: Гаркавин (от «гаркавый» — хрипловатый), Гаркалов (от «гаркать»), Гаркуша (уменьшительная форма). Все они восходят к одному звукоподражательному корню. Так что предок носителя фамилии Гаркунова, скорее всего, был человеком с громким голосом — возможно, глашатаем, певчим или просто тем, кто любил покричать на базаре.