Фамилию Фамилин можно назвать «говорящей» — она образована от слова «фамилия», но не в том значении, которое мы вкладываем сегодня. В старину «фамилией» называли не родовое имя, а семью, домочадцев: «вся фамилия собралась». Поэтому прозвище Фамила могли дать человеку, который был особенно привязан к дому, заботился о родне, или, наоборот, тому, кто всё время поминал своих домочадцев в разговоре. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Фамилин — «сын Фамилы» или «из семьи Фамилы».

Слово «фамилия» пришло в русский язык из латыни через польское посредничество в XVII–XVIII веках. Однако фамилия Фамилин могла появиться раньше — как прозвище, образованное от заимствованного слова, которое уже бытовало в народной речи. В некоторых говорах «фамилией» называли также жену или хозяйку в доме, так что Фамилой могли прозвать женщину, а её дети и муж получили фамилию Фамилины.

С точки зрения словообразовательной модели, Фамилин — типичная «именная» фамилия на -ин, как Дружинин, Гостин или Барышнин. Встречается она преимущественно в центральных и северных областях России, где фамилии на -ин особенно распространены. Редкость фамилии объясняется тем, что основа «фамил-» не была популярным прозвищем — в крестьянской среде чаще использовали конкретные черты характера или внешности.

Другие версии происхождения менее убедительны. Например, связь с латинским «familia» (семья) напрямую — это скорее кабинетная этимология, не учитывающая, что фамилии в народе образовывались от живых прозвищ, а не от книжных терминов. В любом случае, Фамилин — редкий пример фамилии, которая сама рассказывает о своём значении, стоит лишь заглянуть в историю слова.