Фамилия Фаропонова — женская форма редкой фамилии Фаропонов. С первого взгляда она кажется искажением более привычного «Фарафонов» или «Ферапонтов», и это предположение не лишено оснований. Однако замена звуков в фамилиях — не случайность, а часто маркер диалектного произношения или ошибки писаря, которая закрепилась в документах.

Самая вероятная версия связывает фамилию с каноническим мужским именем Ферапонт (греч. Therapontos — «слуга», «спутник»). В русской народной речи имя Ферапонт нередко произносили как «Фарапон» или «Форофон» — так язык упрощал малознакомое сочетание звуков. От формы «Фарапон» и возникла фамилия Фарапонов, а её вариант «Фаропонов» — результат дальнейшего фонетического сдвига (замена «а» на «о» под влиянием акающих говоров, где в безударном положении звуки не различаются). Суффикс -ов указывает на типичную модель русской фамилии: «чей?» — «сын Фарапона» (Фаропона).

Менее вероятная, но не исключенная гипотеза — связь с прозвищем Фаропон, которое могло возникнуть от диалектного глагола «фарапать» (делать что-то небрежно, пачкать) или от звукоподражания «фара-фара» (бормотать, говорить невнятно). Однако в этом случае фамилия осталась бы единичной, без параллельных форм, тогда как варианты Фарафонов и Ферапонтов встречаются чаще, что говорит в пользу имени как основы.

Сословно фамилия Фаропоновых не знатная — такие фамилии на -ов обычно носили крестьяне, реже купцы и мещане. Географически фамилия редкая, её очаги могут быть связаны с северными и центральными губерниями России, где имя Ферапонт было более распространено благодаря почитанию святого Ферапонта Можайского. Встречается она и в старообрядческой среде, где держались за старые календарные имена.

Таким образом, Фаропонова — это фамилия, в которой народная фонетика перекроила церковное имя, и теперь по ней можно судить о том, как в конкретной местности звучало слово, записанное когда-то в метрической книге.