Фамилия Фасхутинова — редкий случай, когда основа не славянская, а тюркско-арабская, а суффикс — классический русский. Она образована по продуктивной модели на -ов/-ев, но с характерным для татарских и башкирских фамилий ударением на предпоследний слог. Основа — мужское имя Фасхутдин (или Фасхутдин), которое в свою очередь восходит к арабскому Фасх ад-Дин, что переводится как «победа веры» или «открывающий врата религии». Имя это составное: «фасх» (открытие, победа) и «дин» (вера, религия). В русской среде такие имена часто адаптировали, отсекая арабский артикль и добавляя славянский патронимический суффикс.

Форма Фасхутинова — женская, от мужской Фасхутинов. Встречается преимущественно у татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья, где были распространены мусульманские имена с корнем «дин». В отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я), здесь использован суффикс -ов, что типично для адаптации тюркских имен в русской документации: имя Фасхутдин дало Фасхутдинов, а затем, с редукцией гласных в разговорной речи, закрепился вариант Фасхутинов. Это не ошибка, а живой процесс упрощения.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии в XIX — начале XX века чаще всего были крестьянами или мещанами из Казанской, Уфимской или Оренбургской губерний. Фамилия не дворянская, не купеческая — она массовая, но не частая. Её редкость объясняется тем, что полная форма (Фасхутдинов) встречается намного чаще, а усечённый вариант остался локальным, возможно, в одном-двух родах.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Фасхутдинов, Фасхиев, Фасхутдинов — то Фасхутинова стоит особняком из-за выпадения слога «-ди-». Это не универсальное правило, а особенность конкретной ветви. В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) такие случаи разбираются как примеры фонетической редукции в живой речи, зафиксированной в документах.