Фамилия Фасхудинов — одна из тех, что сразу указывает на мусульманское происхождение. Её основа — арабское имя Фасхуддин (варианты: Фасхудин, Фасхетдин). Оно состоит из двух корней: «фасх» (араб. فسح — «расширение», «простор») и «дин» (араб. دين — «вера», «религия»). В буквальном переводе имя означает «расширение веры» или «процветание религии». Это теофорное имя, то есть содержащее отсылку к Богу или вере, типичное для мусульманских народов Поволжья и Приуралья.

Фамилия образована по русской патронимической модели. К имени Фасхуддин добавили русский суффикс -ов, который в тюрко-татарской среде закрепился как основной способ оформления фамилий. Получается: Фасхуддин + ов = Фасхудинов. Буква «х» в середине — результат адаптации арабского гортанного звука к русской фонетике. Встречаются варианты написания Фасхутдинов (с «т» вместо «х»), но это уже результат другого диалектного произношения.

Географически фамилия почти полностью привязана к регионам проживания татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Ульяновская области. Встречается она и среди казанских татар, и у мишарей. Сословно носители фамилии в XIX веке чаще всего были государственными крестьянами или мещанами, реже — купцами или муллами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Примечательная деталь: в отличие от многих арабских имён, где «дин» стоит на первом месте (например, Динмухаммед), здесь он — вторая часть. Это классическая конструкция для имён с религиозным значением: Гайнутдин, Шарафутдин, Фасхутдин. Фамилия Фасхудинов — один из живых примеров того, как арабская лексика через исламскую традицию стала основой для русских по форме, но тюркских по происхождению фамилий.