Фамилия Фаттахитдинова — одна из тех, что сразу выдают мусульманское происхождение и книжную, религиозную традицию. В основе лежит арабское имя Фаттахетдин (Фаттах ад-Дин), что в переводе означает «победа веры» или «открывающий врата религии». Здесь «Фаттах» — одно из имён Аллаха в исламе («Открывающий», «Дарующий победу»), а «дин» — вера. Сложносоставные имена с компонентом «дин» были очень популярны в среде татарского и башкирского духовенства, и именно в этих тюркских культурах фамилия Фаттахитдинова и её мужской вариант Фаттахитдинов встречаются чаще всего.

С точки зрения словообразования, фамилия прошла долгий путь. Сначала полное арабское имя Фаттахетдин адаптировалось к тюркскому произношению, утратив часть звуков (так появилась форма Фаттахитдин). Затем к нему присоединили русский патронимический суффикс -ов, а для женской формы — -а. Суффикс указывает, что фамилия закрепилась в документах относительно поздно, в XIX — начале XX века, когда у татар и башкир начался массовый процесс перехода от отчеств по отцу к наследственным фамилиям по русскому образцу.

Интересная деталь: в этой фамилии два суффикса подряд — сначала тюркский -ит, который мог служить для адаптации арабского звучания, а потом уже русский -ов. Такая цепочка встречается реже, чем простое присоединение окончания к имени, и выдает фамилию, которая формировалась не в канцелярии, а в живой речи, где имя сначала «обрусело» на слух, а потом было записано.

Носители фамилии Фаттахитдинова — это потомки людей, чьи отцы носили имя с явным религиозным смыслом. Скорее всего, предок был либо муллой, либо учителем в медресе, либо просто глубоко верующим человеком, которого так назвали в честь одного из эпитетов Бога. Географически фамилия тяготеет к Татарстану и Башкортостану, реже встречается у казанских татар, проживающих в других регионах России.