Фамилия Файзулаева образована от мужского мусульманского имени Файзулла, которое переводится с арабского как «щедрость Аллаха» или «милость Аллаха». Имя это составное: первая часть «файз» означает «изобилие, щедрость, благодать», вторая — «Аллах». Нарекая сына Файзуллой, родители вкладывали в имя пожелание, чтобы он рос достойным мусульманином, а сама «щедрость» здесь понимается не столько как черта характера, сколько как божественная благодать, ниспосланная свыше.

Фамилия построена по классической для русских фамилий модели: к основе Файзула добавлен суффикс -ев, а затем окончание -а, указывающее на женский род. Мужской вариант — Файзулаев. Такое оформление типично для фамилий, которые возникали в среде татар, башкир и других народов, исповедующих ислам, но живших в тесном взаимодействии с русскоязычной культурой. Суффикс -ев присоединяют к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или «й», поэтому от Файзуллы закономерно получился Файзулаев.

Интересно, что само имя Файзулла в разных регионах и диалектах могло произноситься по-разному: где-то — Файзула, где-то — Файзулла. Отсюда и варианты написания фамилии: Файзулаев, Файзуллин, а также более редкие формы. Фамилия Файзуллин образована уже не суффиксом -ев, а суффиксом -ин, что тоже встречается при адаптации тюркских имён. Впрочем, Файзулаева — одна из самых распространённых форм, и она напрямую сохраняет звучание исходного имени.

Процесс формирования таких фамилий у мусульманских народов Поволжья и Урала был длительным и завершился в основном к концу XIX — началу XX века. Часто фамилией становилось имя отца или деда, записанное в метрических книгах или документах переписи. Поэтому Файзулаева означает буквально «дочь (или потомок) Файзуллы». Точное место и время возникновения конкретного рода Файзулаевых можно установить только через генеалогические исследования, но сам корень указывает на глубокую религиозную традицию и уважение к имени, данному при рождении.