Фамилия Файзутдинова — женская форма мужской фамилии Файзутдинов, и её корни уходят в татарскую и башкирскую ономастику. Основа фамилии — арабское имя Файзутдин, которое состоит из двух частей: «файз» (изобилие, щедрость, благодать) и «дин» (вера, религия). Вместе имя переводится как «благодать веры» или «щедрость религии». Это типичное для мусульманских народов сложносоставное имя, где вторая часть отсылает к исламу, а первая — к положительному качеству или дару.

Модель образования фамилии проста: русский патронимический суффикс -ов присоединился к татарскому имени Файзутдин, а затем появилось окончание -а для женского варианта. Такие фамилии на -ов/-ев массово возникли у татар и башкир в XIX — начале XX века, когда по указу властей им пришлось фиксировать родовые прозвания по русскому образцу. До этого многие обходились только личным именем и именем отца.

Интересная деталь: у фамилии Файзутдинова есть однокоренные варианты — Файзуллин (от «файзулла» — «щедрость Аллаха») и Файзутдинов. Разница в суффиксе: -уллин указывает на арабскую конструкцию с именем Аллаха, а -утдинов — на слово «дин». Встречается также написание Файзутдинова, где гласная «у» заменяет «ю» — это региональная особенность произношения, характерная для некоторых говоров татарского языка.

Носительницы этой фамилии — в основном потомки татарских или башкирских крестьян, ремесленников, а также духовных лиц (мулл), поскольку имя Файзутдин было популярно среди образованных мусульман. В советское время фамилия распространилась по Уралу, Поволжью и Сибири, где компактно живут татары и башкиры. Встречается она и у казахов, но реже — там предпочитают форму Файзутдинов с казахской адаптацией.

Споров о происхождении нет: корень прозрачный, арабский, с чёткой религиозной окраской. Если искать редкий угол, можно обратить внимание на то, что в дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать как Файзутдинова или Файзутдинова — с двояким ударением. В современном русском языке ударение обычно падает на предпоследний слог: Файзутди́нова.