Фамилия Фетисенкова образована от краткой разговорной формы Фетис, которая в старину заменяла полное церковное имя Феоктист. В основе лежит древнегреческое Theoktistos — «богами сотворенный». Такое сокращение — типичная народная привычка: длинное и трудное для повседневной речи имя ужимали до короткого и звучного, которое легко ложилось в обращение.

Судя по форме, основатель рода был человеком простого звания. В крестьянской и мещанской среде полные имена в быту почти не использовали, поэтому в документах и переписях люди чаще фигурировали под уменьшительными вариантами. Именно от такого обиходного имени Фетис и пошла фамильная цепочка.

Сама фамилия имеет украинский след. Форма Фетисенко с патронимическим суффиксом -енко указывает на территорию современной Украины, где так строили фамилии сыновей: Фетисенко — сын Фетиса. Скорее всего, род Фетисенко перебрался в великорусские губернии, и там фамилия русифицировалась: к основе добавили суффикс -ова, превратив мужскую форму в женскую — Фетисенкова. Такое явление встречалось сплошь и рядом: при переезде или при записи в новые реестры окончание меняли на привычное для местного уха.

Суффикс -ова в женском варианте указывает на принадлежность: Фетисенкова — дочь или жена Фетисенко. Мужская параллель — Фетисенков. Подобные пары типичны для фамилий, которые формировались на стыке двух культурных традиций — украинской и русской.

Если говорить о родственных фамилиях, то к этому же корню восходят Фетисов, Фетисович, Фетюков. Все они так или иначе отталкиваются от имени Фетис, но строятся по разным моделям. Фетисенкова выделяется тем, что в ней соединились сразу два пласта: украинский патроним и русское окончание, что делает её любопытным примером фамильной миграции.

Точных дат появления фамилии и сведений о конкретных носителях в открытых источниках нет, но сам механизм её возникновения прослеживается ясно: от имени — к отчеству, от отчества — к фамилии, которая пережила русификацию и закрепилась в современном виде.