Фамилия Филипушкин — редкий пример того, как простое крестильное имя обрастает неожиданными суффиксами. В основе лежит каноническое имя Филипп (от греческого «любящий коней»), но не прямо, а через уменьшительную форму Филипушка. Суффикс -ушк- в русских именах передавал ласкательный или обиходный оттенок: так звали ребенка или младшего в семье. А вот конечное -ин указывает на принадлежность: Филипушкин буквально означает «сын Филипушки» или «человек из дома Филипушки».

Обычно фамилии на -ин образовывались от основ на -а/-я: Иванов — от Иван, а Филипушкин — от Филипушка. Но здесь интересна сама промежуточная форма. В XIX веке имя Филипп было распространено во всех сословиях, но ласкательный вариант «Филипушка» чаще встречался в крестьянской и мещанской среде, где в быту использовали именно такие «домашние» именования. Поэтому Филипушкин — фамилия недворянская, скорее всего, из северных или центральных губерний России, где суффикс -ушк- был особенно живуч.

Можно сравнить с однокоренными: Филиппов — самая частая форма, Филипьев — от старой церковной формы, а Филипушкин стоит особняком. По данным переписей, фамилия встречается точечно, без ярко выраженного гнезда — это подтверждает её происхождение от личного прозвища, а не от географического названия. Если ваш предок носил фамилию Филипушкин, скорее всего, его деда или отца в деревне звали ласково Филипушкой, и это прозвище закрепилось за родом.