Фамилия Филяюшкина — женская форма, в мужском варианте — Филяюшкин. Её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт региональную особенность. Формант -ушкин характерен для северных и центральных областей России (Архангельская, Вологодская, Костромская губернии), где уменьшительные имена с суффиксом -уша были особенно популярны. Этот суффикс превращал крестильное имя или прозвище в ласкательную форму, а затем фамилия на -ин закрепляла её за потомками.

В основе фамилии лежит имя Филя, которое само по себе — краткая форма от нескольких полных имён. Чаще всего это Филипп (греч. «любящий коней»), но может быть и Филарет («любящий добродетель»), и Философ («любящий мудрость»), и даже Филофей («любящий Бога»). В народной среде такие сокращения были обычны: Филя — Филюша — Филяюшка. Промежуточная форма Филяюшка — это уже не просто уменьшительное, а двойное ласкательное образование, которое бытовало в устной речи и затем попало в фамилию.

Таким образом, Филяюшкин — буквально «чей-то сын, потомок Филяюшки». Первым носителем фамилии мог стать человек, которого в быту звали ласково Филяюшка, то есть маленький Филя или внук Фила. Социальный статус предка, скорее всего, был крестьянским или посадским: сложные уменьшительные фамилии на -ушкин редко встречались у дворян, которые чаще брали фамилии по географическим названиям или по полным формам имени.

Интересно, что фамилия Филяюшкина не имеет однозначной связи с каким-либо ремеслом или прозвищем по черте характера — всё упирается в личное имя. В этом её отличие от более прозрачных фамилий вроде Кузнецов или Смирнов. Географически фамилия редкая, встречается точечно: по данным современных справочников, основные носители жили в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает миграцию населения из северных областей в XVII–XVIII веках.

В написании фамилии возможна путаница: иногда её путают с Филюшкин (от Филюшка) или Филякин (от Филяка). Но суффикс -юшк- в Филяюшкин — более редкий и говорит о том, что исходная форма имени была не просто Филя, а именно Филяюшка, с характерным северным произношением. Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он происходил из среды крестьян или мещан, а его далёкого предка звали попросту Филя.