Основой фамилии Филючков послужило мирское имя Филючка. Фамилия Филючков восходит к каноническому мужскому имени Филипп, которое в переводе с древнегреческого означает «любитель лошадей». В основу фамилии легла просторечная форма – Филючка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филючка, со временем получил фамилию Филючков.